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Combiner le web sémantique et la modélisation pour organiser des données phénotypiques acquises à différentes échelles d’organisation des plantes

Résumé

Les récents développements dans le domaine de la phénomique végétale ont permis l’acquisition massive de données d’une grande valeur dans différents contextes (ex. champs vs. plateformes contrôlées) et différents échelles d’organisation (ex. organe, plante, couvert). La réutilisation et ré-analyse de ces données est confrontée aux problèmes liés aux caractéristiques multi-origine et multi-échelle des données ainsi qu’à la difficulté de développer des systèmes d’information capables d’organiser cette masse d’information. Dans ce contexte, nous formulons l’hypothèse que l’utilisation d’équations issues de la modélisation permet d’améliorer les processus d'alignements pour relier des concepts et variables à différentes échelles d’organisation. L’objectif principal de cette thèse consistera ainsi à combiner la modélisation de cultures et des techniques dans le domaine du web sémantique afin de faciliter l’alignement de ces concepts. Ceci permettra de développer un cadre conceptuel facilitant l’organisation de jeux de données acquis en conditions de plein champ et en plateforme de phénotypage et de relier des concepts à différents échelles d’organisation tout en créant des liens dynamiques. Enfin, nous espérons que le cadre conceptuel développé pendant cette thèse facilitera l’assemblage de futurs jeux de données permettant leur réutilisation et ré-analyse afin de générer de nouvelles connaissances.